1. BAISOGALOS BAŽNYČIA
F195 163 s. vnt. 1539–1959 m.
2. BAŽNYČIŲ ARCHYVŲ DOKUMENTŲ KOLEKCIJA (Darbėnų, Debeikių, Eišiškių, Kaišiadorių, Klovainių, Kupiškio, Lėliūnų, Lenkimų, Mosėdžio, Palėvenės, Salantų, Šaukoto, Šateikių, Šiluvos, Šumsko, Utenos, Vyžuonų bažnyčių archyvų likučiai)
F196 192 s. vnt. 1645–1988 m.
3. BRESLAUJOS BAŽNYČIA
F197 21 s. vnt. 1827–1950 m.
4. JONIŠKĖLIO BAŽNYČIA
F201 129 s. vnt. 1701–1922 m.
5. PAŠUŠVIO BAŽNYČIA
F203 55 s. vnt. 1576–1941 m.
6. SKAPIŠKIO BAŽNYČIA
F204 34 s. vnt. 1718–1921 m.
7. SKIRSNEMUNĖS BAŽNYČIA
F205 8 s. vnt. 1801–1915 m.
8. ŠIAULĖNŲ BAŽNYČIA
F107 329 s. vnt. 1618–1955 m.
9. UKMERGĖS DEKANATAS
F207 20 s. vnt. 1828–1908 m.
10. UPYTĖS BAŽNYČIA
F208 5 s. vnt. 1849–1921 m.
11. VILNIAUS DIECEZINĖ KUNIGŲ SEMINARIJA
F210 382 s. vnt. 1583–1879 m.
12. VILNIAUS KAPITULA
F57 1 880 l. s. vnt. XVII–XIX a.
13. VILNIAUS ŠV. PETRO IR POVILO BAŽNYČIA
F68 24 s. vnt. 1678–1700 m.
14. ŽOLUDĖS BAŽNYČIA
F164 410 s. vnt. 1674–1962 m.